166.231 Angewandte Bioinformatik
Diese Lehrveranstaltung ist in allen zugeordneten Curricula Teil der STEOP.
Diese Lehrveranstaltung ist in mindestens einem zugeordneten Curriculum Teil der STEOP.

2020S, UE, 4.0h, 4.0EC, wird geblockt abgehalten
TUWEL

Merkmale

  • Semesterwochenstunden: 4.0
  • ECTS: 4.0
  • Typ: UE Übung

Lernergebnisse

Nach positiver Absolvierung der Lehrveranstaltung sind Studierende in der Lage bioinformatische Werkzeuge anzuwenden. Sie besitzen die Fähigkeit für zukünftige wissenschaftliche Fragestellungen die passenden Lösungen zu identifizieren und zu implementieren. Sie sind versiert in der fokussierten Suche nach wissenschaftlicher Literatur zu einem konkreten Fachgebiet. Weiters sind sie vertraut mit den wichtigsten online Ressourcen und Datenbanken im Bereich der Lebenswissenschaften. 

 

Inhalt der Lehrveranstaltung

Es wird anhand von Vorträgen und Demonstrationen das Grundgerüst zu eigenständigen Recherche nach biologischen Datensätzen (z.B. Nukleinsäure oder Protein Sequenzen) und bioinformatischen Werkzeugen ermöglicht. Studierende lösen die gestellten Anforderungen aber auch durch selbständiges absolvieren von Tutorials, Recherche im Netz und das gezielte Studium von Software Dokumentationen. 

Es werden Fertigkeiten in der Anwendung von grundlegenden, für die Bioinformatik essenziellen Fertigkeiten wie die Benutzung von Unix/Linux Systemen oder die Statistikumgebung/Programmiersprache R erarbeitet. 

Des Weiteren bietet die Lehrveranstaltung Gelegenheit, sich ausführlich mit den Ressourcen, Möglichkeiten und Schnittstellen von Online-Platformen und Datenbanken zu beschäftigen.


Methoden

Einführung in die Übungsthemen, selbständige Erarbeitung bioinformatischer Fertigkeiten, Vorbereitung der Ergebnisse als Präsentation, Präsentation der Ergebnisse, Diskussion  und Feedback zur Präsentation

Prüfungsmodus

Schriftlich und Mündlich

Vortragende

Institut

LVA Termine

TagZeitDatumOrtBeschreibung
Do.17:00 - 18:3002.04.2020 Online via TUWEL/ZOOMEinführung and Tutorial 1 - NCBI Tools und Unix
Do.16:30 - 17:3023.04.2020 Online via TUWEL/ZOOMTutorial 2 - Q&A Genome Assembly
Do.16:30 - 18:0030.04.2020 Online via TUWEL/ZOOMTutorial 3 - R/DADA2
Do.16:00 - 18:0004.06.2020 TUWEL/ZOOMBeratungssession
Fr.09:00 - 16:0012.06.2020 TUWEL/ZOOMPräsentationen
LVA wird geblockt abgehalten

Leistungsnachweis

Anwesenheitspflicht bei Einführungssessions und Präsentationssessions, Vortrag der Ergebnisse und Abgabe der Präsentation als PDF. 

LVA-Anmeldung

Von Bis Abmeldung bis
19.02.2020 00:00 24.03.2020 23:59 25.03.2020 23:59

Anmeldemodalitäten:

Bei Überbelegung erfolgt die Aufnahme der Hörer/-innen nach folgenden Kriterien (in der Reihenfolge gewichtet):

1. Spezialisierung "Biotechnologie und Bioanalytik" im Masterstudium "Technische Chemie"

2. Erstbesucher

3. VO "Angewandte Bioinformatik" positiv absolviert

4. Zeitpunkt der Anmeldung zur gegenständlichen UE

 

Curricula

Literatur

Es wird kein Skriptum zur Lehrveranstaltung angeboten.

Vorkenntnisse

Grundkenntnisse im Umgang mit Computern. 

Grundkenntnisse im Umgang mit, Betriebsystemen (Terminal) und Programmiersprachen sind von Vorteil aber nicht Voraussetzung für die Teilnahme.

Die Absolvierung der Lehrveranstaltungen VO Angewandte Bioinformatik (166.229) und VO Gentechnik und Industrielle Genomik (166.229) ist als Vorkenntnis empfehlenswert.

Für die Übungen wird ein Computer unter Windows, MacOS oder Linux und ein Zugang zum Internet benötigt. 

Die Mitnahme dieses Computers zu den Terminen (Launch und Tutorials) ist von Vorteil und erleichtert die spätere Abarbeitung der Übungsbeispiele beträchtlich.

Vorausgehende Lehrveranstaltungen

Weitere Informationen

  • Anwesenheitspflicht!

Sprache

Deutsch