Nach positiver Absolvierung der Lehrveranstaltung sind Studierende in der Lage metabolomische Fragestellungen zu identifizieren, sei es in der Grundlagenforschung, in der angewandten Forschung oder Qualitätskontrolle. Lernziel ist es, verschiedene Strategien zu kennen und die richtige für die diversen Fragestellungen aussuchen zu können. Studierende werden diverse Metabolomikexperimente designen können und die Probenvorbereitung, Analysen und bioinformatische Datenanalyse theoretisch anwenden können. Das inkludiert das Wissen, wie man Metabolite aus biologischer Matrix extrahiert, mittels chromatographischer (LC, GC, TLC) Methoden separiert, wie man Metabolite mittels Tandem-Massenspektrometrie (MS/MS), Ionenmobilität (IMS) und LC-(IMS)-MS/MS Datenanalyse identifiziert, charakterisiert und quantifiziert und funktionell annotiert. Ebenso werden die Studierenden die statistische Auswertung metabolomischer Daten lernen und damit signifikante quantitative Unterschiede errechnen können.

Strategien und Methoden der Metabolomanalyse: Ausgangsbedingungen und Definition der Fragestellung, Probenvorbereitung inkl. Methoden zur Extraktion und Reduktion der Probenkomplexität, Identifizierung und Quantifizierung der Metabolite, Strukturcharakterisierung der Metabolite, High-throughput Techniken, (Tandem) Massenspektrometrie, Ionenmobilität, Flüssig/Gaschromatographie, Erläuterung der bioinformatischen Werkzeuge zur Identifizierung, Quantifizierung und Annotation

Vorlesung mit praktischer Übung (z. B. MS/MS Spektruminterpretation, Nutzung von Webtools)

Präsentation und Diskussion von Anwendungsbeispielen

Präsentation und Diskussion eines Metabolomik-Fallbeispiels

Kopien der ppt-Folien werden zum Herunterladen über TISS bereitgestellt.

Vorkenntnisse der Biochemie und instrumenteller Analytik sind unabdingbar. Instrumentelle Bioanalytik wird empfohlen.