164.355 Proteomics
Diese Lehrveranstaltung ist in allen zugeordneten Curricula Teil der STEOP.
Diese Lehrveranstaltung ist in mindestens einem zugeordneten Curriculum Teil der STEOP.

2021W, VO, 1.5h, 2.0EC

Merkmale

  • Semesterwochenstunden: 1.5
  • ECTS: 2.0
  • Typ: VO Vorlesung
  • Format der Abhaltung: Distance Learning

Lernergebnisse

Nach positiver Absolvierung der Lehrveranstaltung sind Studierende in der Lage proteomische Fragestellungen zu identifizieren, sei es in der Grundlagenforschung, in der angewandten Forschung oder Qualitätskontrolle. Lernziel ist es, verschiedene Strategien zu kennen und die richtige für die diversen Fragestellungen aussuchen zu können. Studierende werden diverse Proteomikexperimente designen können und die Probenvorbereitung, Proteomikanalysen und bioinformatische Datenanalyse theoretisch anwenden können. Das inkludiert das Wissen, wie man Proteine und Peptide mittels elektrophoretischer und flüssigchromatographischer (LC) Methoden separiert, wie man Proteine und komplexe Proteome mittels Tandem-Massenspektrometrie (MS/MS), Ionenmobilität (IMS) und LC-(IMS)-MS/MS Datenanalyse identifiziert, charakterisiert und quantifiziert, und wie man Proteine und ihre Modifikationen funktionell annotiert. Ebenso werden die Studierenden die statistische Auswertung proteomischer Daten lernen und damit Proteinidentifizierungskonfidenz und signifikante quantitative Unterschiede errechnen können.

 

Inhalt der Lehrveranstaltung

Strategien und Methoden der Proteomanalyse: Ausgangsbedingungen und Definition der Fragestellung, Probenvorbereitung inkl. Methoden zur Reduktion der Proteomkomplexität, Identifizierung und Quantifizierung der Proteine, Strukturcharakterisierung der Proteine und deren posttranslationalen und anderen Modifikationen, funktionelle Proteomik, High-throughput Techniken, (Tandem) Massenspektrometrie, Ionenmobilität, Flüssigchromatographie, Erläuterung der bioinformatischen Werkzeuge zur Proteinidentifizierung, -quantifizierung und annotation

Methoden

Vorlesung mit praktischer Übung (z. B. manuelle MS/MS Spektruminterpretation eines Peptids, Nutzung von Webtools)

Präsentation und Diskussion von Anwendungsbeispielen

Prüfungsmodus

Prüfungsimmanent

Vortragende Personen

Institut

LVA Termine

TagZeitDatumOrtBeschreibung
Di.16:00 - 19:0012.10.2021 - 14.12.2021 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09 (LIVE)Zoom Vortrag
Proteomics - Einzeltermine
TagDatumZeitOrtBeschreibung
Di.12.10.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag
Di.19.10.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag
Di.23.11.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag
Di.30.11.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag
Di.07.12.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag
Di.14.12.202116:00 - 19:00 https://tuwien.zoom.us/j/94048263126?pwd=ellpcVVXM1doZmt0M1hRNDVxQURIZz09Zoom Vortrag

Leistungsnachweis

Präsentation und Diskussion eines Proteomik-Fallbeispiels

Prüfungen

TagZeitDatumOrtPrüfungsmodusAnmeldefristAnmeldungPrüfung
Di. - 07.12.2021mündlichKeine Anmeldung-Online Prüfung
Di. - 14.12.2021mündlichKeine Anmeldung-Online Prüfung

LVA-Anmeldung

Von Bis Abmeldung bis
05.10.2021 14:00 31.10.2021 00:00 31.10.2021 00:00

Curricula

StudienkennzahlSemesterAnm.Bed.Info
066 490 Technische Chemie

Literatur

Kopien der ppt-Folien werden zum Herunterladen über TISS bereitgestellt.

Vorkenntnisse

Vorkenntnisse der Proteinchemie, Biochemie und instrumenteller Analytik sind unabdingbar.

Weitere Informationen

  • Anwesenheitspflicht!

Sprache

Englisch